Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMD6Q15008 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PSMD6Q15008 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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