Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
COL9A3Q14050 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
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