Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DDX39BQ13838 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
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