Protein–RNA interactions for Protein: Q13591

SEMA5A, Semaphorin-5A, humanhuman

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA5AQ13591 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA5AQ13591 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA5AQ13591 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA5AQ13591 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA5AQ13591 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA5AQ13591 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA5AQ13591 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA5AQ13591 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA5AQ13591 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA5AQ13591 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA5AQ13591 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA5AQ13591 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA5AQ13591 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA5AQ13591 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA5AQ13591 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA5AQ13591 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA5AQ13591 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA5AQ13591 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA5AQ13591 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA5AQ13591 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA5AQ13591 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA5AQ13591 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA5AQ13591 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA5AQ13591 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA5AQ13591 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA5AQ13591 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA5AQ13591 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA5AQ13591 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA5AQ13591 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA5AQ13591 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA5AQ13591 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA5AQ13591 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA5AQ13591 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA5AQ13591 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA5AQ13591 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA5AQ13591 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA5AQ13591 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA5AQ13591 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA5AQ13591 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA5AQ13591 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA5AQ13591 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA5AQ13591 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA5AQ13591 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA5AQ13591 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA5AQ13591 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA5AQ13591 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA5AQ13591 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA5AQ13591 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA5AQ13591 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA5AQ13591 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA5AQ13591 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA5AQ13591 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA5AQ13591 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA5AQ13591 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA5AQ13591 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA5AQ13591 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA5AQ13591 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA5AQ13591 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA5AQ13591 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA5AQ13591 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA5AQ13591 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA5AQ13591 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA5AQ13591 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA5AQ13591 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA5AQ13591 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA5AQ13591 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA5AQ13591 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA5AQ13591 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA5AQ13591 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA5AQ13591 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA5AQ13591 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA5AQ13591 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA5AQ13591 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA5AQ13591 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA5AQ13591 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA5AQ13591 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA5AQ13591 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA5AQ13591 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA5AQ13591 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA5AQ13591 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA5AQ13591 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA5AQ13591 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA5AQ13591 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA5AQ13591 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA5AQ13591 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA5AQ13591 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA5AQ13591 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA5AQ13591 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA5AQ13591 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA5AQ13591 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA5AQ13591 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA5AQ13591 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA5AQ13591 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA5AQ13591 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA5AQ13591 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA5AQ13591 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA5AQ13591 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA5AQ13591 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA5AQ13591 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SEMA5AQ13591 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms