Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LSAMPQ13449 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
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