Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
XRCC4Q13426 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
XRCC4Q13426 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
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