Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SP140Q13342 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SP140Q13342 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SP140Q13342 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SP140Q13342 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SP140Q13342 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SP140Q13342 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SP140Q13342 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SP140Q13342 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SP140Q13342 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SP140Q13342 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SP140Q13342 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SP140Q13342 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SP140Q13342 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SP140Q13342 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SP140Q13342 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SP140Q13342 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SP140Q13342 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SP140Q13342 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SP140Q13342 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SP140Q13342 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SP140Q13342 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SP140Q13342 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SP140Q13342 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SP140Q13342 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SP140Q13342 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SP140Q13342 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SP140Q13342 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SP140Q13342 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SP140Q13342 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SP140Q13342 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SP140Q13342 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SP140Q13342 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SP140Q13342 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SP140Q13342 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SP140Q13342 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SP140Q13342 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SP140Q13342 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
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SP140Q13342 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SP140Q13342 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SP140Q13342 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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SP140Q13342 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SP140Q13342 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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SP140Q13342 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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SP140Q13342 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SP140Q13342 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SP140Q13342 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SP140Q13342 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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SP140Q13342 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SP140Q13342 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SP140Q13342 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
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SP140Q13342 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SP140Q13342 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SP140Q13342 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SP140Q13342 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SP140Q13342 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SP140Q13342 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SP140Q13342 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SP140Q13342 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
SP140Q13342 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SP140Q13342 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SP140Q13342 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SP140Q13342 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SP140Q13342 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SP140Q13342 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SP140Q13342 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SP140Q13342 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SP140Q13342 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SP140Q13342 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SP140Q13342 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SP140Q13342 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SP140Q13342 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SP140Q13342 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SP140Q13342 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SP140Q13342 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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