Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRSF5Q13243 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
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