Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
NFIAQ12857 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NFIAQ12857 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.4 ms