Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB40BQ12829 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB40BQ12829 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB40BQ12829 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB40BQ12829 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB40BQ12829 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB40BQ12829 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB40BQ12829 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB40BQ12829 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB40BQ12829 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB40BQ12829 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB40BQ12829 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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RAB40BQ12829 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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RAB40BQ12829 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
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RAB40BQ12829 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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RAB40BQ12829 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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RAB40BQ12829 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
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RAB40BQ12829 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB40BQ12829 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
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