Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 BX248415.1-201ENST00000367421 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 LHFPL3-AS1-202ENST00000416376 866 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 AL139280.1-201ENST00000436340 463 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 AL353718.1-201ENST00000451028 517 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 DUXA-201ENST00000554048 1006 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 MKKS-203ENST00000609375 882 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 OR4C5-201ENST00000319813 981 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 FAM204CP-201ENST00000424489 642 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 AL606534.1-201ENST00000439562 694 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 AC096631.1-202ENST00000440162 917 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TNP2Q05952 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms