Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
CACNA1BQ00975 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms