Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms