Protein–RNA interactions for Protein: P84243

H3F3A, Histone H3.3, humanhuman

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3AP84243 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
H3F3AP84243 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
H3F3AP84243 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
H3F3AP84243 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
H3F3AP84243 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
H3F3AP84243 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
H3F3AP84243 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
H3F3AP84243 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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H3F3AP84243 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
H3F3AP84243 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
H3F3AP84243 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H3F3AP84243 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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H3F3AP84243 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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H3F3AP84243 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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H3F3AP84243 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H3F3AP84243 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H3F3AP84243 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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H3F3AP84243 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H3F3AP84243 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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H3F3AP84243 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H3F3AP84243 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
H3F3AP84243 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
H3F3AP84243 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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H3F3AP84243 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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H3F3AP84243 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
H3F3AP84243 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
H3F3AP84243 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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H3F3AP84243 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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H3F3AP84243 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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H3F3AP84243 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H3F3AP84243 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15□□□□□ -0.01
H3F3AP84243 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
H3F3AP84243 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15□□□□□ -0.01
H3F3AP84243 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
H3F3AP84243 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
H3F3AP84243 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H3F3AP84243 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
H3F3AP84243 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H3F3AP84243 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H3F3AP84243 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H3F3AP84243 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
H3F3AP84243 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
H3F3AP84243 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15□□□□□ -0.01
H3F3AP84243 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H3F3AP84243 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H3F3AP84243 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
H3F3AP84243 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
H3F3AP84243 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
H3F3AP84243 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H3F3AP84243 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
H3F3AP84243 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
H3F3AP84243 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H3F3AP84243 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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