Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVFC1P60507 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVFC1P60507 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVFC1P60507 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVFC1P60507 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVFC1P60507 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVFC1P60507 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVFC1P60507 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVFC1P60507 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ERVFC1P60507 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ERVFC1P60507 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ERVFC1P60507 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ERVFC1P60507 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ERVFC1P60507 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ERVFC1P60507 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ERVFC1P60507 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ERVFC1P60507 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ERVFC1P60507 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ERVFC1P60507 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ERVFC1P60507 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ERVFC1P60507 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVFC1P60507 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVFC1P60507 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVFC1P60507 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVFC1P60507 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVFC1P60507 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVFC1P60507 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVFC1P60507 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVFC1P60507 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVFC1P60507 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVFC1P60507 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVFC1P60507 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVFC1P60507 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVFC1P60507 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVFC1P60507 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVFC1P60507 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVFC1P60507 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVFC1P60507 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVFC1P60507 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVFC1P60507 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVFC1P60507 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVFC1P60507 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVFC1P60507 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVFC1P60507 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVFC1P60507 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVFC1P60507 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVFC1P60507 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVFC1P60507 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVFC1P60507 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVFC1P60507 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVFC1P60507 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVFC1P60507 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVFC1P60507 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVFC1P60507 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVFC1P60507 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVFC1P60507 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVFC1P60507 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVFC1P60507 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVFC1P60507 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVFC1P60507 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVFC1P60507 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVFC1P60507 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVFC1P60507 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVFC1P60507 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVFC1P60507 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVFC1P60507 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVFC1P60507 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVFC1P60507 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVFC1P60507 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVFC1P60507 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVFC1P60507 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVFC1P60507 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVFC1P60507 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVFC1P60507 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVFC1P60507 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVFC1P60507 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVFC1P60507 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVFC1P60507 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVFC1P60507 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVFC1P60507 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVFC1P60507 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVFC1P60507 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVFC1P60507 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVFC1P60507 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVFC1P60507 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVFC1P60507 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVFC1P60507 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVFC1P60507 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVFC1P60507 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVFC1P60507 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVFC1P60507 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVFC1P60507 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVFC1P60507 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVFC1P60507 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVFC1P60507 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVFC1P60507 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVFC1P60507 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVFC1P60507 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVFC1P60507 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVFC1P60507 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms