Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SH3BGRP55822 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms