Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ETV1P50549 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ETV1P50549 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ETV1P50549 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
ETV1P50549 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
ETV1P50549 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ETV1P50549 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ETV1P50549 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ETV1P50549 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ETV1P50549 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ETV1P50549 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ETV1P50549 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ETV1P50549 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ETV1P50549 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ETV1P50549 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ETV1P50549 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ETV1P50549 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ETV1P50549 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ETV1P50549 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ETV1P50549 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ETV1P50549 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ETV1P50549 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ETV1P50549 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ETV1P50549 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ETV1P50549 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ETV1P50549 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ETV1P50549 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ETV1P50549 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ETV1P50549 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ETV1P50549 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ETV1P50549 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ETV1P50549 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ETV1P50549 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ETV1P50549 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ETV1P50549 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ETV1P50549 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ETV1P50549 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
ETV1P50549 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ETV1P50549 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ETV1P50549 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ETV1P50549 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ETV1P50549 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ETV1P50549 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ETV1P50549 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ETV1P50549 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ETV1P50549 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ETV1P50549 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ETV1P50549 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ETV1P50549 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ETV1P50549 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ETV1P50549 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ETV1P50549 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ETV1P50549 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ETV1P50549 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ETV1P50549 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ETV1P50549 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ETV1P50549 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ETV1P50549 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ETV1P50549 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ETV1P50549 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ETV1P50549 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ETV1P50549 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ETV1P50549 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ETV1P50549 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ETV1P50549 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ETV1P50549 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ETV1P50549 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ETV1P50549 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ETV1P50549 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ETV1P50549 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ETV1P50549 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ETV1P50549 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ETV1P50549 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ETV1P50549 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ETV1P50549 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ETV1P50549 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ETV1P50549 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ETV1P50549 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ETV1P50549 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ETV1P50549 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ETV1P50549 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ETV1P50549 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ETV1P50549 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ETV1P50549 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ETV1P50549 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ETV1P50549 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ETV1P50549 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ETV1P50549 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ETV1P50549 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ETV1P50549 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ETV1P50549 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ETV1P50549 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ETV1P50549 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ETV1P50549 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ETV1P50549 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
ETV1P50549 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ETV1P50549 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ETV1P50549 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ETV1P50549 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ETV1P50549 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms