Protein–RNA interactions for Protein: P49418

AMPH, Amphiphysin, humanhuman

Predictions only

Length 695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMPHP49418 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AMPHP49418 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AMPHP49418 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AMPHP49418 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AMPHP49418 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AMPHP49418 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AMPHP49418 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AMPHP49418 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
AMPHP49418 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AMPHP49418 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AMPHP49418 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AMPHP49418 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AMPHP49418 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AMPHP49418 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AMPHP49418 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AMPHP49418 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AMPHP49418 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AMPHP49418 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AMPHP49418 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AMPHP49418 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AMPHP49418 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AMPHP49418 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AMPHP49418 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AMPHP49418 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AMPHP49418 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AMPHP49418 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AMPHP49418 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AMPHP49418 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AMPHP49418 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AMPHP49418 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AMPHP49418 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AMPHP49418 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
AMPHP49418 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AMPHP49418 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AMPHP49418 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
AMPHP49418 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AMPHP49418 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AMPHP49418 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AMPHP49418 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AMPHP49418 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
AMPHP49418 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AMPHP49418 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AMPHP49418 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AMPHP49418 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AMPHP49418 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AMPHP49418 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AMPHP49418 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AMPHP49418 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AMPHP49418 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AMPHP49418 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
AMPHP49418 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AMPHP49418 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AMPHP49418 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AMPHP49418 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AMPHP49418 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AMPHP49418 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AMPHP49418 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AMPHP49418 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AMPHP49418 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AMPHP49418 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
AMPHP49418 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AMPHP49418 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AMPHP49418 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AMPHP49418 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AMPHP49418 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AMPHP49418 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AMPHP49418 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AMPHP49418 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AMPHP49418 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AMPHP49418 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AMPHP49418 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AMPHP49418 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AMPHP49418 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AMPHP49418 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AMPHP49418 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
AMPHP49418 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AMPHP49418 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AMPHP49418 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AMPHP49418 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AMPHP49418 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
AMPHP49418 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AMPHP49418 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AMPHP49418 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AMPHP49418 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AMPHP49418 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AMPHP49418 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AMPHP49418 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AMPHP49418 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AMPHP49418 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AMPHP49418 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AMPHP49418 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AMPHP49418 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AMPHP49418 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AMPHP49418 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AMPHP49418 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AMPHP49418 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AMPHP49418 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AMPHP49418 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AMPHP49418 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
AMPHP49418 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms