Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms