Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ITGAEP38570 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms