Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GJC1P36383 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GJC1P36383 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GJC1P36383 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GJC1P36383 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GJC1P36383 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GJC1P36383 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GJC1P36383 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GJC1P36383 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GJC1P36383 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GJC1P36383 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GJC1P36383 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GJC1P36383 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GJC1P36383 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GJC1P36383 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GJC1P36383 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GJC1P36383 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GJC1P36383 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GJC1P36383 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GJC1P36383 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GJC1P36383 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GJC1P36383 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GJC1P36383 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GJC1P36383 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GJC1P36383 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GJC1P36383 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GJC1P36383 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GJC1P36383 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GJC1P36383 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
GJC1P36383 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GJC1P36383 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GJC1P36383 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GJC1P36383 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GJC1P36383 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GJC1P36383 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GJC1P36383 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GJC1P36383 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GJC1P36383 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GJC1P36383 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GJC1P36383 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GJC1P36383 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GJC1P36383 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GJC1P36383 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GJC1P36383 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GJC1P36383 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GJC1P36383 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GJC1P36383 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GJC1P36383 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GJC1P36383 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GJC1P36383 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GJC1P36383 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GJC1P36383 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GJC1P36383 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GJC1P36383 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GJC1P36383 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GJC1P36383 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GJC1P36383 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GJC1P36383 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GJC1P36383 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GJC1P36383 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GJC1P36383 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GJC1P36383 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GJC1P36383 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GJC1P36383 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GJC1P36383 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GJC1P36383 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GJC1P36383 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GJC1P36383 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GJC1P36383 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GJC1P36383 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GJC1P36383 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GJC1P36383 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GJC1P36383 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GJC1P36383 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GJC1P36383 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GJC1P36383 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GJC1P36383 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GJC1P36383 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GJC1P36383 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GJC1P36383 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GJC1P36383 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GJC1P36383 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GJC1P36383 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GJC1P36383 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GJC1P36383 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GJC1P36383 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GJC1P36383 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GJC1P36383 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GJC1P36383 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GJC1P36383 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GJC1P36383 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GJC1P36383 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GJC1P36383 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GJC1P36383 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GJC1P36383 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GJC1P36383 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GJC1P36383 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GJC1P36383 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GJC1P36383 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GJC1P36383 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms