Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCKBRP32239 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.3 ms