Protein–RNA interactions for Protein: P28288

ABCD3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD3P28288 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms