Protein–RNA interactions for Protein: P25054

APC, Adenomatous polyposis coli protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCP25054 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
APCP25054 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
APCP25054 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
APCP25054 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
APCP25054 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
APCP25054 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
APCP25054 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
APCP25054 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
APCP25054 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
APCP25054 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
APCP25054 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
APCP25054 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
APCP25054 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
APCP25054 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
APCP25054 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
APCP25054 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
APCP25054 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
APCP25054 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
APCP25054 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
APCP25054 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
APCP25054 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
APCP25054 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
APCP25054 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
APCP25054 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
APCP25054 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
APCP25054 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
APCP25054 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
APCP25054 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
APCP25054 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
APCP25054 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
APCP25054 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
APCP25054 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
APCP25054 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
APCP25054 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
APCP25054 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
APCP25054 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
APCP25054 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
APCP25054 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
APCP25054 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
APCP25054 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
APCP25054 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
APCP25054 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
APCP25054 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
APCP25054 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
APCP25054 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
APCP25054 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
APCP25054 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
APCP25054 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
APCP25054 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
APCP25054 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
APCP25054 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
APCP25054 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
APCP25054 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
APCP25054 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
APCP25054 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
APCP25054 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
APCP25054 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
APCP25054 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
APCP25054 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
APCP25054 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
APCP25054 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
APCP25054 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
APCP25054 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
APCP25054 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
APCP25054 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
APCP25054 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
APCP25054 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
APCP25054 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
APCP25054 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
APCP25054 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
APCP25054 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
APCP25054 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
APCP25054 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
APCP25054 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
APCP25054 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
APCP25054 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
APCP25054 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
APCP25054 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
APCP25054 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
APCP25054 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
APCP25054 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
APCP25054 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
APCP25054 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
APCP25054 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
APCP25054 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
APCP25054 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
APCP25054 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
APCP25054 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
APCP25054 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
APCP25054 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
APCP25054 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
APCP25054 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
APCP25054 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
APCP25054 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
APCP25054 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
APCP25054 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
APCP25054 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
APCP25054 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
APCP25054 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
APCP25054 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms