Protein–RNA interactions for Protein: P18031

PTPN1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN1P18031 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN1P18031 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN1P18031 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN1P18031 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN1P18031 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN1P18031 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN1P18031 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN1P18031 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN1P18031 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN1P18031 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN1P18031 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN1P18031 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN1P18031 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN1P18031 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN1P18031 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN1P18031 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN1P18031 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN1P18031 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN1P18031 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN1P18031 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN1P18031 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN1P18031 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN1P18031 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN1P18031 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN1P18031 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN1P18031 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN1P18031 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN1P18031 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN1P18031 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN1P18031 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN1P18031 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN1P18031 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN1P18031 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN1P18031 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN1P18031 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN1P18031 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN1P18031 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN1P18031 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN1P18031 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN1P18031 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN1P18031 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN1P18031 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN1P18031 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN1P18031 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN1P18031 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN1P18031 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN1P18031 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN1P18031 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN1P18031 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN1P18031 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN1P18031 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN1P18031 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN1P18031 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN1P18031 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN1P18031 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN1P18031 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN1P18031 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN1P18031 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN1P18031 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN1P18031 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN1P18031 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN1P18031 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN1P18031 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN1P18031 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN1P18031 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN1P18031 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN1P18031 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN1P18031 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN1P18031 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN1P18031 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN1P18031 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN1P18031 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN1P18031 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN1P18031 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN1P18031 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN1P18031 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN1P18031 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN1P18031 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN1P18031 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN1P18031 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN1P18031 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN1P18031 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN1P18031 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN1P18031 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN1P18031 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN1P18031 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN1P18031 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN1P18031 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN1P18031 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN1P18031 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN1P18031 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN1P18031 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN1P18031 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN1P18031 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN1P18031 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN1P18031 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN1P18031 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN1P18031 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN1P18031 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN1P18031 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms