Protein–RNA interactions for Protein: P14867

GABRA1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1P14867 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRA1P14867 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms