Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.84□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms