Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ODC1P11926 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ODC1P11926 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ODC1P11926 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ODC1P11926 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ODC1P11926 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ODC1P11926 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ODC1P11926 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ODC1P11926 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ODC1P11926 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ODC1P11926 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ODC1P11926 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ODC1P11926 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ODC1P11926 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ODC1P11926 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ODC1P11926 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ODC1P11926 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ODC1P11926 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ODC1P11926 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ODC1P11926 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ODC1P11926 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ODC1P11926 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ODC1P11926 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ODC1P11926 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ODC1P11926 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ODC1P11926 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ODC1P11926 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ODC1P11926 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ODC1P11926 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ODC1P11926 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ODC1P11926 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ODC1P11926 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ODC1P11926 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ODC1P11926 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ODC1P11926 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ODC1P11926 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ODC1P11926 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ODC1P11926 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ODC1P11926 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ODC1P11926 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ODC1P11926 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ODC1P11926 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ODC1P11926 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ODC1P11926 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ODC1P11926 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ODC1P11926 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ODC1P11926 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ODC1P11926 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ODC1P11926 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ODC1P11926 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ODC1P11926 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ODC1P11926 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ODC1P11926 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ODC1P11926 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ODC1P11926 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ODC1P11926 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ODC1P11926 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ODC1P11926 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ODC1P11926 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ODC1P11926 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ODC1P11926 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ODC1P11926 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ODC1P11926 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ODC1P11926 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ODC1P11926 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ODC1P11926 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ODC1P11926 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ODC1P11926 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ODC1P11926 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ODC1P11926 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ODC1P11926 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ODC1P11926 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ODC1P11926 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ODC1P11926 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ODC1P11926 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ODC1P11926 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ODC1P11926 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ODC1P11926 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ODC1P11926 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ODC1P11926 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ODC1P11926 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODC1P11926 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODC1P11926 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODC1P11926 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODC1P11926 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODC1P11926 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODC1P11926 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODC1P11926 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODC1P11926 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODC1P11926 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODC1P11926 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODC1P11926 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODC1P11926 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODC1P11926 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODC1P11926 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODC1P11926 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODC1P11926 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODC1P11926 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODC1P11926 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ODC1P11926 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms