Protein–RNA interactions for Protein: P04433

IGKV3-11, Immunoglobulin kappa variable 3-11, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV3-11P04433 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV3-11P04433 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV3-11P04433 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV3-11P04433 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV3-11P04433 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV3-11P04433 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV3-11P04433 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV3-11P04433 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV3-11P04433 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV3-11P04433 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV3-11P04433 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV3-11P04433 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV3-11P04433 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV3-11P04433 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV3-11P04433 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGKV3-11P04433 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV3-11P04433 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV3-11P04433 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV3-11P04433 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV3-11P04433 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV3-11P04433 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV3-11P04433 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV3-11P04433 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV3-11P04433 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV3-11P04433 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV3-11P04433 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV3-11P04433 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV3-11P04433 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV3-11P04433 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV3-11P04433 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV3-11P04433 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV3-11P04433 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV3-11P04433 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV3-11P04433 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV3-11P04433 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV3-11P04433 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV3-11P04433 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV3-11P04433 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV3-11P04433 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV3-11P04433 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV3-11P04433 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV3-11P04433 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV3-11P04433 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV3-11P04433 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV3-11P04433 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV3-11P04433 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV3-11P04433 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV3-11P04433 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV3-11P04433 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV3-11P04433 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV3-11P04433 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV3-11P04433 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV3-11P04433 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV3-11P04433 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV3-11P04433 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV3-11P04433 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV3-11P04433 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV3-11P04433 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV3-11P04433 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV3-11P04433 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV3-11P04433 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV3-11P04433 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV3-11P04433 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV3-11P04433 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV3-11P04433 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV3-11P04433 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV3-11P04433 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV3-11P04433 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV3-11P04433 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV3-11P04433 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV3-11P04433 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV3-11P04433 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGKV3-11P04433 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV3-11P04433 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV3-11P04433 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV3-11P04433 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV3-11P04433 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV3-11P04433 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV3-11P04433 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV3-11P04433 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV3-11P04433 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV3-11P04433 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV3-11P04433 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV3-11P04433 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV3-11P04433 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV3-11P04433 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV3-11P04433 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV3-11P04433 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV3-11P04433 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV3-11P04433 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV3-11P04433 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV3-11P04433 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV3-11P04433 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV3-11P04433 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV3-11P04433 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV3-11P04433 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV3-11P04433 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV3-11P04433 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV3-11P04433 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGKV3-11P04433 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms