Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HLA-DQB1P01920 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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