Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA2O43364 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA2O43364 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA2O43364 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA2O43364 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA2O43364 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA2O43364 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA2O43364 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA2O43364 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA2O43364 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA2O43364 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA2O43364 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA2O43364 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA2O43364 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA2O43364 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA2O43364 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA2O43364 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA2O43364 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA2O43364 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA2O43364 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA2O43364 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA2O43364 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA2O43364 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA2O43364 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXA2O43364 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXA2O43364 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXA2O43364 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXA2O43364 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXA2O43364 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXA2O43364 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXA2O43364 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXA2O43364 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXA2O43364 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXA2O43364 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXA2O43364 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXA2O43364 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA2O43364 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.3 ms