Protein–RNA interactions for Protein: O15178

T, Brachyury protein, humanhuman

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Length 435 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TO15178 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TO15178 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TO15178 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TO15178 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TO15178 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TO15178 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TO15178 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TO15178 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TO15178 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TO15178 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TO15178 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TO15178 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TO15178 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TO15178 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TO15178 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TO15178 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TO15178 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TO15178 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TO15178 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TO15178 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TO15178 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TO15178 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TO15178 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TO15178 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TO15178 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TO15178 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TO15178 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TO15178 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TO15178 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TO15178 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TO15178 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TO15178 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TO15178 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TO15178 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TO15178 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TO15178 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TO15178 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TO15178 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TO15178 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TO15178 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TO15178 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TO15178 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TO15178 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TO15178 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TO15178 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TO15178 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TO15178 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TO15178 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TO15178 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TO15178 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TO15178 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TO15178 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TO15178 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TO15178 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TO15178 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TO15178 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TO15178 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TO15178 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TO15178 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TO15178 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TO15178 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TO15178 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TO15178 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TO15178 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TO15178 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TO15178 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TO15178 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TO15178 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TO15178 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TO15178 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TO15178 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TO15178 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TO15178 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TO15178 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TO15178 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TO15178 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TO15178 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TO15178 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TO15178 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TO15178 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TO15178 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TO15178 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TO15178 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TO15178 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TO15178 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TO15178 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TO15178 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TO15178 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TO15178 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TO15178 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TO15178 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TO15178 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TO15178 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TO15178 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TO15178 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TO15178 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TO15178 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TO15178 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TO15178 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TO15178 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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