Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms