Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms