Protein–RNA interactions for Protein: A0PJW6

TMEM223, Transmembrane protein 223, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM223A0PJW6 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TMEM223A0PJW6 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TMEM223A0PJW6 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TMEM223A0PJW6 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TMEM223A0PJW6 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TMEM223A0PJW6 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TMEM223A0PJW6 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TMEM223A0PJW6 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TMEM223A0PJW6 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TMEM223A0PJW6 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TMEM223A0PJW6 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TMEM223A0PJW6 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM223A0PJW6 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM223A0PJW6 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM223A0PJW6 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM223A0PJW6 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM223A0PJW6 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM223A0PJW6 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM223A0PJW6 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM223A0PJW6 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM223A0PJW6 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM223A0PJW6 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM223A0PJW6 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM223A0PJW6 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM223A0PJW6 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM223A0PJW6 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM223A0PJW6 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM223A0PJW6 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM223A0PJW6 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM223A0PJW6 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM223A0PJW6 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM223A0PJW6 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM223A0PJW6 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM223A0PJW6 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM223A0PJW6 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM223A0PJW6 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM223A0PJW6 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM223A0PJW6 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM223A0PJW6 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM223A0PJW6 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM223A0PJW6 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM223A0PJW6 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM223A0PJW6 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM223A0PJW6 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM223A0PJW6 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM223A0PJW6 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM223A0PJW6 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM223A0PJW6 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM223A0PJW6 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM223A0PJW6 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM223A0PJW6 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM223A0PJW6 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM223A0PJW6 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM223A0PJW6 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM223A0PJW6 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM223A0PJW6 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM223A0PJW6 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM223A0PJW6 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM223A0PJW6 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM223A0PJW6 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM223A0PJW6 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM223A0PJW6 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM223A0PJW6 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM223A0PJW6 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM223A0PJW6 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM223A0PJW6 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM223A0PJW6 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM223A0PJW6 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM223A0PJW6 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM223A0PJW6 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM223A0PJW6 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM223A0PJW6 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM223A0PJW6 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM223A0PJW6 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM223A0PJW6 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM223A0PJW6 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM223A0PJW6 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM223A0PJW6 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM223A0PJW6 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM223A0PJW6 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM223A0PJW6 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM223A0PJW6 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM223A0PJW6 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM223A0PJW6 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM223A0PJW6 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM223A0PJW6 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM223A0PJW6 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM223A0PJW6 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TMEM223A0PJW6 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TMEM223A0PJW6 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TMEM223A0PJW6 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TMEM223A0PJW6 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
TMEM223A0PJW6 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TMEM223A0PJW6 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TMEM223A0PJW6 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TMEM223A0PJW6 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TMEM223A0PJW6 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TMEM223A0PJW6 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TMEM223A0PJW6 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TMEM223A0PJW6 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms