Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms