Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9Y3F1 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9Y3F1 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9Y3F1 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9Y3F1 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9Y3F1 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9Y3F1 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9Y3F1 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9Y3F1 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9Y3F1 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9Y3F1 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9Y3F1 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9Y3F1 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9Y3F1 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9Y3F1 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9Y3F1 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9Y3F1 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9Y3F1 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9Y3F1 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9Y3F1 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9Y3F1 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9Y3F1 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9Y3F1 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9Y3F1 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9Y3F1 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9Y3F1 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9Y3F1 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9Y3F1 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9Y3F1 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9Y3F1 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9Y3F1 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9Y3F1 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9Y3F1 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9Y3F1 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9Y3F1 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9Y3F1 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9Y3F1 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9Y3F1 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9Y3F1 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9Y3F1 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9Y3F1 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9Y3F1 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9Y3F1 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9Y3F1 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9Y3F1 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9Y3F1 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9Y3F1 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9Y3F1 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9Y3F1 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9Y3F1 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9Y3F1 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9Y3F1 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9Y3F1 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9Y3F1 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9Y3F1 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9Y3F1 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9Y3F1 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9Y3F1 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9Y3F1 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9Y3F1 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9Y3F1 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9Y3F1 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9Y3F1 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9Y3F1 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9Y3F1 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9Y3F1 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9Y3F1 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9Y3F1 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9Y3F1 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9Y3F1 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9Y3F1 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9Y3F1 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9Y3F1 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9Y3F1 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9Y3F1 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9Y3F1 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9Y3F1 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9Y3F1 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9Y3F1 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9Y3F1 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9Y3F1 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9Y3F1 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9Y3F1 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9Y3F1 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9Y3F1 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9Y3F1 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9Y3F1 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9Y3F1 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9Y3F1 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9Y3F1 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9Y3F1 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9Y3F1 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9Y3F1 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9Y3F1 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9Y3F1 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9Y3F1 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9Y3F1 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9Y3F1 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9Y3F1 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9Y3F1 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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