Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DTX4Q9Y2E6 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms