Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN37

VPS4A, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS4AQ9UN37 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VPS4AQ9UN37 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VPS4AQ9UN37 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VPS4AQ9UN37 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VPS4AQ9UN37 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VPS4AQ9UN37 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VPS4AQ9UN37 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VPS4AQ9UN37 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VPS4AQ9UN37 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VPS4AQ9UN37 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
VPS4AQ9UN37 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VPS4AQ9UN37 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
VPS4AQ9UN37 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VPS4AQ9UN37 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VPS4AQ9UN37 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VPS4AQ9UN37 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VPS4AQ9UN37 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VPS4AQ9UN37 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VPS4AQ9UN37 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
VPS4AQ9UN37 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VPS4AQ9UN37 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VPS4AQ9UN37 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VPS4AQ9UN37 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VPS4AQ9UN37 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VPS4AQ9UN37 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VPS4AQ9UN37 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VPS4AQ9UN37 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VPS4AQ9UN37 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VPS4AQ9UN37 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VPS4AQ9UN37 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VPS4AQ9UN37 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
VPS4AQ9UN37 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VPS4AQ9UN37 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VPS4AQ9UN37 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VPS4AQ9UN37 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VPS4AQ9UN37 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VPS4AQ9UN37 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VPS4AQ9UN37 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VPS4AQ9UN37 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VPS4AQ9UN37 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VPS4AQ9UN37 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VPS4AQ9UN37 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms