Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RIMS3Q9UJD0 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms