Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
COPS7AQ9UBW8 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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