Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

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Length 350 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DKK3Q9UBP4 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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