Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC6

MED17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED17Q9NVC6 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MED17Q9NVC6 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MED17Q9NVC6 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MED17Q9NVC6 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MED17Q9NVC6 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MED17Q9NVC6 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
MED17Q9NVC6 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MED17Q9NVC6 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MED17Q9NVC6 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MED17Q9NVC6 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MED17Q9NVC6 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MED17Q9NVC6 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
MED17Q9NVC6 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MED17Q9NVC6 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MED17Q9NVC6 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED17Q9NVC6 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED17Q9NVC6 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED17Q9NVC6 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED17Q9NVC6 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED17Q9NVC6 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED17Q9NVC6 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED17Q9NVC6 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED17Q9NVC6 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED17Q9NVC6 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED17Q9NVC6 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED17Q9NVC6 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED17Q9NVC6 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED17Q9NVC6 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED17Q9NVC6 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED17Q9NVC6 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED17Q9NVC6 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED17Q9NVC6 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED17Q9NVC6 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED17Q9NVC6 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED17Q9NVC6 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED17Q9NVC6 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MED17Q9NVC6 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MED17Q9NVC6 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED17Q9NVC6 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED17Q9NVC6 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED17Q9NVC6 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED17Q9NVC6 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MED17Q9NVC6 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED17Q9NVC6 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED17Q9NVC6 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED17Q9NVC6 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED17Q9NVC6 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED17Q9NVC6 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED17Q9NVC6 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED17Q9NVC6 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED17Q9NVC6 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED17Q9NVC6 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED17Q9NVC6 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED17Q9NVC6 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MED17Q9NVC6 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED17Q9NVC6 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED17Q9NVC6 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED17Q9NVC6 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED17Q9NVC6 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED17Q9NVC6 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms