Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms