Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ROPN1BQ9BZX4 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ROPN1BQ9BZX4 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ROPN1BQ9BZX4 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ROPN1BQ9BZX4 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ROPN1BQ9BZX4 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ROPN1BQ9BZX4 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ROPN1BQ9BZX4 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ROPN1BQ9BZX4 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ROPN1BQ9BZX4 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ROPN1BQ9BZX4 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ROPN1BQ9BZX4 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ROPN1BQ9BZX4 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ROPN1BQ9BZX4 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ROPN1BQ9BZX4 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ROPN1BQ9BZX4 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ROPN1BQ9BZX4 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ROPN1BQ9BZX4 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ROPN1BQ9BZX4 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ROPN1BQ9BZX4 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ROPN1BQ9BZX4 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ROPN1BQ9BZX4 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ROPN1BQ9BZX4 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ROPN1BQ9BZX4 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ROPN1BQ9BZX4 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ROPN1BQ9BZX4 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ROPN1BQ9BZX4 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ROPN1BQ9BZX4 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ROPN1BQ9BZX4 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ROPN1BQ9BZX4 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ROPN1BQ9BZX4 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ROPN1BQ9BZX4 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ROPN1BQ9BZX4 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ROPN1BQ9BZX4 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ROPN1BQ9BZX4 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ROPN1BQ9BZX4 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ROPN1BQ9BZX4 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ROPN1BQ9BZX4 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ROPN1BQ9BZX4 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ROPN1BQ9BZX4 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ROPN1BQ9BZX4 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ROPN1BQ9BZX4 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ROPN1BQ9BZX4 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ROPN1BQ9BZX4 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ROPN1BQ9BZX4 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ROPN1BQ9BZX4 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ROPN1BQ9BZX4 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ROPN1BQ9BZX4 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ROPN1BQ9BZX4 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ROPN1BQ9BZX4 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ROPN1BQ9BZX4 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ROPN1BQ9BZX4 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ROPN1BQ9BZX4 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ROPN1BQ9BZX4 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ROPN1BQ9BZX4 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ROPN1BQ9BZX4 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ROPN1BQ9BZX4 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ROPN1BQ9BZX4 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ROPN1BQ9BZX4 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms