Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
MAP1LC3CQ9BXW4 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms