Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms