Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BRIP1Q9BX63 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms