Protein–RNA interactions for Protein: Q99717

SMAD5, Mothers against decapentaplegic homolog 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5Q99717 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD5Q99717 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms