Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKP4Q99569 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKP4Q99569 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKP4Q99569 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKP4Q99569 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKP4Q99569 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKP4Q99569 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKP4Q99569 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKP4Q99569 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKP4Q99569 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKP4Q99569 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKP4Q99569 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKP4Q99569 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKP4Q99569 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKP4Q99569 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKP4Q99569 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKP4Q99569 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKP4Q99569 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PKP4Q99569 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKP4Q99569 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKP4Q99569 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKP4Q99569 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKP4Q99569 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKP4Q99569 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKP4Q99569 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PKP4Q99569 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PKP4Q99569 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PKP4Q99569 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PKP4Q99569 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PKP4Q99569 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PKP4Q99569 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PKP4Q99569 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PKP4Q99569 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PKP4Q99569 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PKP4Q99569 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PKP4Q99569 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PKP4Q99569 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PKP4Q99569 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PKP4Q99569 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PKP4Q99569 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PKP4Q99569 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PKP4Q99569 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PKP4Q99569 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PKP4Q99569 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PKP4Q99569 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PKP4Q99569 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PKP4Q99569 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PKP4Q99569 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PKP4Q99569 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PKP4Q99569 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PKP4Q99569 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PKP4Q99569 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PKP4Q99569 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PKP4Q99569 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PKP4Q99569 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PKP4Q99569 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PKP4Q99569 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PKP4Q99569 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PKP4Q99569 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PKP4Q99569 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PKP4Q99569 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PKP4Q99569 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PKP4Q99569 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PKP4Q99569 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PKP4Q99569 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PKP4Q99569 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PKP4Q99569 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PKP4Q99569 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PKP4Q99569 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PKP4Q99569 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PKP4Q99569 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PKP4Q99569 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PKP4Q99569 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PKP4Q99569 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PKP4Q99569 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKP4Q99569 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKP4Q99569 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PKP4Q99569 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKP4Q99569 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKP4Q99569 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKP4Q99569 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKP4Q99569 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKP4Q99569 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKP4Q99569 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKP4Q99569 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKP4Q99569 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKP4Q99569 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKP4Q99569 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKP4Q99569 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKP4Q99569 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKP4Q99569 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKP4Q99569 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKP4Q99569 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKP4Q99569 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKP4Q99569 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKP4Q99569 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKP4Q99569 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKP4Q99569 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKP4Q99569 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PKP4Q99569 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms